Prípravné procedúry predchádzajúce nočnému odberu materiálu začali v stredu, kedy sonda začala zostup zo svojej parkovacej pozície vo výške zhruba 20 kilometrov nad povrchom. Odborníci pre kontakt vybrali priestor označovaný ako L08-E1. Nachádza sa v blízkosti rovníka asteroidu medzi krátermi Kontár a Brabo. Celá operácia prebiehala automaticky, pretože povely zo Zeme by putovali k sonde príliš dlho.
Vo chvíli, keď sa zberná hubica dotkla povrchu, vystrelil z nej rýchlosťou 300 metrov za sekundu päťgramový projektil z tantalu. Častice asteroidu, ktoré sa po náraze vymrštili do priestoru, hubica odobrala. Sekundu po kontakte hubice s povrchom potom sonda, ktorá technicky stále klesala, zapálila motory a začala opäť stúpať.
JAXA na základe prijatých telemetrických dát uviedla, že sonda je v poriadku a že jej systémy pracujú normálne. Aj tak ale aparát čaká rozsiahla previerka jeho stavu, ktorá potrvá zrejme niekoľko dní.
Sonda má v pláne ďalšie dve priblíženia pre zber vzoriek. Počas posledného pokusu chcú vedci získať materiál z hĺbky. Na povrch preto z výšky 500 metrov vystrelí projektil, ktorý vytvorí kráter. Z jeho dna potom sonda vzorku odoberie.
Hajabusa 2 dorazila k asteroidu po tri a pol roku letu vlani v júni. Sonda už na povrch dopravila kontajner MINERVA-II 1 s dvojicou robotov pomenovaných Rover-1A a Rover-1B a tiež nemecký pristávací modul MASCOT. Sonda nesie ešte kontajner MINERVA-II 2, v ktorom je robot Rover-2, pristátie na povrchu je plánované na júl.