Vojenské plavidlo sa potopilo, keď sa v druhom storočí pred naším letopočtom zrútil slávny Amonov chrám, v blízkosti ktorého kotvilo. Predbežná štúdia ukazuje kýl 25 metrov dlhej lode s plochým dnom, s veslami a veľkou plachtou, ktorá bola postavená v klasickom štýle a niesla charakteristiky typické pre lode stavané v dobe antického Egypta.
V ďalšej časti mesta archeológovia odhalili pozostatky veľkej gréckej pohrebnej oblasti, ktorá pochádza z prvých rokov štvrtého storočia pred naším letopočtom.
Herakleion kedysi býval najväčším egyptským prístavom. Ovládal vstup do Egypta pri ústí západnej časti Nílu a dominoval oblasti celé stáročia predtým, než v roku 331 pred naším letopočtom Alexander Veľký založil obďaleč Alexandriu.
Mesto Herakleion zničilo a pokrylo spoločne s veľkou časťou delty Nílu niekoľko zemetrasení a prívalových vĺn. Objavili ho až v roku 2001 archeológovia v zátoke Abú Kír.